埃博拉病毒(EBOV)病毒感染人类不会引发可怕的出血热,发病率和病死率极高。2014年这种病毒在西非造成了相当严重的疫情,丧生人数早已多达11,000人。今年一月份,就在人们以为这场疫情月完结之际,塞拉利昂又经常出现了新的病例。
本期Nature杂志公开发表的一项新的研究展出了便携式基因组测序仪在这次疫情中起着的最重要起到。研究人员用这些测序仪在几内亚创建了行李箱中的基因组测序实验室,对埃博拉患者的样本展开动态测序,森严监控了埃博拉疫情的发展。 基因组测序在疫情频发时十分简单,可以协助人们解读病原体的进化,有针对性地采行控制措施。
过去人们必须把样本送往传统基因组实验室,无法及时取得有效地信息。便携式基因组测序仪可以在疫情频发的地方运营,24小时内就能分解测序信息。 研究人员在几内亚测序了142个埃博拉样本,为世界卫生组织获取了十分详尽的数据,协助传染病学家制止病毒的传播。
过去基因组测序必须大型、简单而且便宜的设施。便携式DNA测序系统让我们需要动态监控疫情发展和病原体进化,必要指导人们的应付措施,Birmingham大学的DrNickLoman说道。 研究人员用于的是英国OxfordNanopore公司的携带型测序仪MinION。
这种纳米孔测序仪还将近100g,便利装载也很低廉。MinION可以放入笔记本电脑的USB模块,在屏幕上表明数据分解的过程。 纵观测序技术的发展历程,没哪一个技术像纳米孔测序那样慢热,但也没哪一个技术像纳米孔测序这么相似普罗大众。纳米孔测序的基础理念早已有十几年历史了,然而从第一篇论文到纳米孔测序的成形,这条道路并不是一帆风顺的。
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